In der Geschäftsstelle werden täglich Entscheidungen für die aktuelle und zukünftige Arbeit der Diakonie in der Region getroffen: Personal- und Finanzentscheidungen gehören genauso dazu, wie die Diskussion von Grundsatzfragen diakonischer Arbeit mit PolitikerInnen. Darüber hinaus wird die Arbeit der verschiedenen Fachabteilungen von der Geschäftsstelle aus koordiniert und verwaltet.